Iako ima mnogo zdravstvenih prednosti i bogat je vlaknima, vitaminima i mineralima, krompir sadrži toksine. Koncentracija glikoalkaloida ili prirodnih toksina najveća je u kori i klicama krompira. Starenje i nepravilno skladištenje mogu uzrokovati klijanje ili pojavu zelene nijanse. Klijanje znači da su nivoi toksina previsoki i krompir više nije siguran za konzumaciju. Stručnjakinja za trovanje Diana M. Pei kaže da konzumacija glikoalkaloida može uzrokovati simptome kao što su povraćanje, bol u stomaku, proljev, glavobolja, crvenilo tena, zbunjenost ili groznica. Kuhanje neće uništiti te spojeve pa nije preporučljivo jesti krompir s klicama ili njegove zelene dijelove.
